宋晓元


SXY.png 姓 名: 宋晓元 教授, 博导,中组部“青年千人计划”入选者
 地 址:安徽省合肥市中国科学技术大学生命学院
 电 话:0551-63607752
 电 邮:songxy5@ustc.edu.cn




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 教育与科研经历
  1996年毕业于北京师范大学生物系,1999年取得分子细胞生物学硕士学位。
  2006年在美国罗彻斯特大学生物系取得分子、细胞和发育生物学博士学位。
  2006-2012年在加州大学圣地亚哥分校进行博士后研究,期间获得癌症研究所博士后奖学金。
  2013年加入中国科学技术大学生命科学学院。
  多年来一直从事基因表达调控、表观遗传学,ncRNA,基因组相互作用等相关研究,在GenesDev. 、Mol Cell Biol.、Nature、PNAS等学术期刊上发表了系列文章。


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 主要研究成果

  在组蛋白磷酸化与基因表达调控的研究中,第一次证明了在体内一个组蛋白变体和另一个组蛋白翻译后修饰之间的“cross-talk”(GenesDev. 2012)。在遗传毒性压力诱导的ncRNA的研究中,共同证明了它对RNA结合蛋白TLS的变构调节并介导其转录抑制, 对ncRNA在基因调控中作用的研究颇具影响力 (Nature 2008)。作为主要参与人开发并完善了一个研究全基因组范围内短程及长程基因组相互作用的低背景高分辨率的新方法 - 3D-DSL技术, 应用这一新技术成功地发现了与人类疾病密切相关的基因沙漠地区的基因增强子远距离地与多个基因位点相互作用并对其起调节作用 (Nature 2011)。
  回国后宋晓元团队创新性地提出lncRNA和CTCF共同参与调控三维染色质构象并构成转录的三维空间调控(Cao 2015),并在双核生物(嗜热四膜虫)的三维基因组结构、年龄依赖的lncRNA参与形成的染色质三维构象在脑衰老过程中对学习记忆相关基因的转录调控等方面进行了深入研究,以期为延缓衰老和防治衰老相关疾病提供新思路。


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 主要研究兴趣
  1.研究由lncRNA和三维基因组结构所组成的三维转录调控在脑衰老中的作用
  2.研究lncRNA和染色质相互作用在精子发生过程中的转录调控作用
  3.研究减数分裂相关特定基因的功能及其分子机制


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 代表性论文
  1.曹俊,程庆宇,罗正誉,彭琦,吴衍,宋晓元*。细胞衰老过程中三维转录调控机制研究。已接收,中国科学。*通讯作者。
  2.Ghanam A.R., Xu Q., Ke Sh., Azhar M., Cheng Q., Song X.#, Shining the Light on Senescence Associated LncRNAs. Aging & Disease.  2016, Accepted#Correesponding author.
  3.Xia H., Cao J., Li Q., Lv Y., Jia W., Ren W., Cheng Q.,Song X., Xu G.. Hepatocellular Carcinoma-propagating Cells are Detectable by Side Population Analysis and Possess an Expression Profile Reflective of a Primitive Origin. Sci Rep. 2016, 11;6:34856.
  4.Cheng Q., Ke S., Ghanam A. R.,Song X. #.LncRNAs: The Ideal Composer of the Melody for Life. Biomedical Sciences. 2016, 2(2): 11-15. #Corresponding author.
  5.Xu Q., Wang R., Ghanam A. R., Yan G., Miao W., Song X. #. The key role of CYC2 during meiosis in Tetrahymena thermophile. Protein & Cell. 2016, 7(4):236-49.#通讯作者。
  6.王斐,宋晓元 #. 长链非编码RNA与脑衰老的研究进展。生命科学. 2016,28(5):602-614.#通讯作者。
  7.Li H., Yang F., Liu C., Xiao P., Xu Y., Liang Z., Liu C., Wang H., Wang W., Zheng W., Zhang W., Ma X., He D., Song X., Cui F., Xu Z., Yi F., Sun JP., Yu X.. Crystal Structure and Substrate Specificity of PTPN12. Cell Rep. 2016 10;15(6):1345-58.
  8.Cao J., Luo Z., Cheng Q., Xu Q., Zhang Y., Wang F., Wu Y., Song X.#. Three-dimensional regulation of transcription. Protein & Cell. 2015, 6(4):241-53.#通讯作者。
  9.Lü M., Tian H., Cao Y., He X., Chen L., Song X., Ping P., Huang H., Sun F.Downregulation of miR-320a/383-sponge-like long non-coding RNA NLC1-C (narcolepsy candidate-region 1 genes) is associated with male infertility and promotes testicular embryonal carcinoma cell proliferation. Cell Death Dis. 2015, doi: 10.1038/cddis.
  10.Li K., Xiao P., Zhang D., Hou X., Ge L., Yang D., Liu H., He D., Chen X., Han K., Song X., Yu X., Fang H., Sun J. Identification of para-Substituted Benzoic Acid Derivatives as Potent Inhibitors of the Protein Phosphatase Slingshot. ChemMedChem. 2015,10(12):1980-7.
  11.Li W.*, Hu Y.*, Oh S.*, Ma Q.*, Merkurjev D., Song X., Zhou X., Liu Z., Tanasa B., He X., Chen AY., Ohgi K., Zhang J., Liu W., and Rosenfeld MG. Condensin I and II Complexes License Full Estrogen Receptor α - Dependent Enhancer Activation. Molecular Cell. 2015,59(2):188-202.共第一作者。
  12.Zhang F., Tanasaa B.*, Merkurjev D. *, Lin C. *,Song X., Li W, Tan Y, Liu Z., Zhang J., Ohgi KA., Kronesa A., Skowronska-Krawczyka D., Rosenfeld MG. Enhancer-bound LDB1 regulates a corticotrope promoter-pausing repression program. PNAS. 2015. 112(5):1380-5共第二作者。
  13.Liu Z., Merkurjey D., Yang F., Li W., Oh S.,Friedman MJ., SongX., Zhang F., Ma Q., Ohgi KA., Krones A., Rosenfeld MG. Enhancer Activation Requires trans-Recruitment of a Mega Transcription Factor Complex. Cell. 2014,159(2):358-73.
  14.Li W, Notani D, Ma Q, Tanasa B, Nunez E, Chen AY, Merkurjev D, Zhang J, Ohgi K, Song X., Oh S, Kim HS, Glass CK, Rosenfeld MG. Functional roles of enhancer RNAs for oestrogen-dependent transcriptional activation. Nature. 2013, 498(7455):516-20.


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