| 报告题目 | 生物大分子中化学反应的分子动力学模拟 |
| 报告人 | 梁睿斌 博士 |
| 报告人单位 | 美国斯坦福大学 |
| 报告时间 | 2018-05-25 |
| 报告地点 | 合肥微尺度物质科学国家研究中心九楼会议室（9004） |
| 主办单位 | 合肥微尺度物质科学国家研究中心、国际化学理论中心(ICCT)、复杂化学体系多尺度动力学学科创新引智基地 |
| 报告介绍 | 报告摘要：
研究生物大分子中化学反应的机理对于蛋白质以及药物的设计合成具有重大意义。分子动力学模拟可以用于计算化学反应的自由能面，从而能够辅助实验方法，在微观原子层面上揭示生物大分子中化学反应的机理。分子动力学模拟的高效率计算依赖于能够快速准确地计算化学反应势能面的方法，而多尺度反应性分子动力学就是这样一种方法。在这次报告中，我将会介绍这一方法的发展以及它的两个重要应用：1.研究细胞色素c 氧化酶中的质子泵机理；2.研究流感病毒M2 通道中的质子传递机理。我同时也会简要介绍利用分子动力学模拟研究生物大分子以及其他系统中的非绝热化学反应。
报告人简介：
梁睿斌，美国斯坦福大学博士后。2011年毕业于清华大学，2016年于美国芝加哥大学获得博士学位。2016—2017在美国加利福尼亚大学伯克利分校William H. Miller教授实验室任博士后；2017年至今在美国斯坦福大学Todd J. Martínez教授实验室任博士后。
研究经历：2012-2016 美国芝加哥大学 Developed new multiscale reactive molecular dynamics methods to study proton transport mechanism in influenza A virus M2 channel and cytochrome c oxidase. (Publications 5 - 9)，Benchmarked and identified the inaccuracy of the self-consistent charge density functional tight binding method (SCC-DFTB) for simulating hydroxide transport in aqueous system and proton transport in biological systems, which led to further improvements of the method. (Publications 10 and 11)； 2016-2017 美国加利福尼亚大学伯克利分校 Developed the symmetrical quasi-classical windowing model applied to the Meyer-Miller Hamiltonian (the SQC/MM approach) to study non-adiabatic processes such as ultrafast exciton transfer in organic semiconductors. (Publications 3 and 4)；
2017年至今美国斯坦福大学 Applied restricted-spin ensemble Kohn-Sham (REKS) method in combination with abinitio multiple spawning (AIMS) method to study photodynamics of channelrhodopsin 2.(Publication 1)，Applied quantum mechanics/molecular mechanics method (QM/MM) to studyhydrogen bond structures in ketosteroid isomerase. (Publication 2) |
